Ist eigentlich ganz einfach. Stell dir einfach vor, du hast zwei Photos und legst sie übereinander. Wenn du jetzt irgendwas von dem darüberliegenden Photo ausschneidest, kommt das darunterliegende zum Vorschein.
So funktioniert das auch mit den Layern.
Es gibt 1001 Wege, deshalb fang ich einfach mal bei ß an ;)
Mach einfach eine neue Datei auf in zB. 800x600, dann öffne die beiden Bilder, die du ineinander überblenden willst.
Ziehe die beiden Bilder mit dem Bewegen-Werkzeug (V) in das neu Bild. Dabei wird automatisch immer eine neue Ebene erstellt. Verschieb die Bilder jetzt so, dass sie übereinander liegen.
Jetzt gibt es 2 Möglichkeiten, wie die Bilder ineinander überblenden kannst:
1. Nimm den Radiergummi ( E) und radier einfach alles weg was du nicht haben willst.
2. Benutze das Lasso und das Auswahlrechteck um die Bereiche zu maskieren die transparent werden sollen. Nachdem die Auswahl steht,
benutze im Menü Ebene > Ebenenmaske hinzufügen > Auswahl maskieren.
Jetzt sollten alle maskierten Bereiche transparent sein, und neben deiner Ebene ( im Ebenenmenü ) ist jetzt eine Miniaturansicht der Ebenenmaske zu sehen. Die Kannst du natürlich auch im nachhinein noch bearbeiten, mit Verläufen versehen...

Aber ich glaube, das reicht erst mal. Jetzt noch ein paar Links zu Tutorials, damit du nicht an der Beschreibung verzweifeln mußt :)

Man kann auch einfach Ebenen mit durch Effekten ineinander überblenden.
Mehr dazu unter:
[url]http://photoshopgurus.info/beginners/ps-blend_modes.shtml[/url]

Und noch ein Link zur Adobe Seite, hier gibts zum Thema "blending" auch noch 2/3 brauchbare Tutorials.
[url]http://www.adobe.com/support/techguides/photoshop/main.html[/url]

Hoffe das hilft dir weiter.